與普通版相比，大眾Atlas R-Line版保留了其大部分設計，整體風格以及采用了大眾最新的家族化設計。細節方面，新車換裝了更加運動化的前格柵造型，包括鑲嵌在中網一側的“R-Line”標識、鍍鉻霧燈裝飾罩、翼子板R-Line裝飾以及專屬鋁合金輪圈等等。內飾方面，新車的中控臺布局與普通版車型并無明顯區別。大眾Atlas R-Line版僅針對細節進行了小幅修改，包括三幅式方向盤底部的“R”鍍鉻裝飾等。